1 июня 1998 года — состоялось первое собрание жителей поселка Сентябрьский по вопросу образования православной общины.
8 января 1999 года — поданы первые 22 прошения о принятии в состав православной общины.
28 февраля 2002 года — подготовлены документы для регистрации православной общины. Проведено собрание в присутствии иерея Феодора Савельева. Принято решение о ходатайстве по созданию приписного прихода. В марте Архиепископ Тобольский и Тюменский Димитрий благословил название прихода.
24 марта 2002 года — выделено временное помещение под молельную комнату (однокомнатная квартира на 1-ом этаже многоэтажного дома).
3 октября 2005 года — подано заявление на имя главы Нефтеюганского района, подписанное членами прихода и жителями поселка о выделении участка под строительство Храма.
Постоянно читаются акафисты, каноны. Приход окормляется клириками Пыть-Яхского православного прихода. Богослужения, таинства крещения, венчания и другие требы выполняются по двунадесятым и большим праздникам, а также по просьбе прихожан.
Настоятель прихода – иерей Мхамадиев Олег.
Настоятель храма в честь Воздвижения Честного и Животворящего Креста Господня поселка Сентябрьский и окормляющий священник общины храма в честь святителя Филофея, митрополита Тобольского и Сибирского в КС-5 освобожден от занимаемых должностей и назначен клириком храма в честь Святого Духа города Нефтеюганска. Иерей Иоанн Рассудов на протяжении четырех лет служил на благо жителей, под его чутким руководством в 2023 году в Сентябрьском возродили воскресную школу.

